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西北農林科技大學動科學院動物基因組與基因功
2021-08-02 

西北農林科技大學動科學院動物基因組與基因功

  近日,西北農林科技大學動科學院動物基因組與基因功能研究團隊在中國家驢遺傳結構和體型大小受選擇信號領域取得進展,在《Journalof Genetics and Genomics》(中科院1區TOP期刊)上在線發表了題為《Genomic Analyses Reveal Distinct Genetic Architectures and Selective Pressures in Chinese Donkeys》的研究論文。我院在讀博士研究生沈加飛、于杰和代學雷為論文的第一作者,黨瑞華副教授為通訊作者。

 

  該研究選取中國家驢12個代表性地方品種共78個樣本進行全基因組重測序,結合從公共數據庫下載的11個野驢全基因組數據共同進行分析,發現中國家驢祖先來源比較單一,但在群體結構上具有明顯的地理分布特征,分為華北平原驢、黃土高原驢和西南高原驢三類。

 

西北農林科技大學動科學院動物基因組與基因功

 

  (A)家驢群體結構;(B)家驢NJ樹;(C)家驢選擇信號與基因型分析

 

  為揭示中國家驢體型差異的遺傳機制,研究人員對大型驢、中型驢和小型驢進行受選擇分析,在家驢3號染色體上發現2個與體高發育密切相關的明星基因NCAPG和LCORL,分別有11個和5個錯義突變位點,共同組成的基因型可以把大型驢與小型驢分開。

 

  該研究解析了中國家驢的群體遺傳結構,篩選出影響中國家驢體型大小的關鍵候選基因與SNP錯義突變位點,為揭示中國家驢地方品種的遺傳多樣性、品種形成的遺傳機制及品種改良提供了理論依據。

 

  全文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1673852721001776

西北農林科技大學動科學院動物基因組與基因功

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